W Instytucie Matki i Dziecka, Prof. Halina Weker kieruje zespołem medyczno-żywieniowym. Ponadto, Prof. Weker pełni funkcję Kierownika Zakładu Żywienia IMiD (do 09.2024r.).
Poza pracą w Instytucie Matki i Dziecka, jest ona także wykładowcą na Wydziale Nauki o Zdrowiu Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego.
Prof. Halina Weker zajmuje się problematyką związaną z żywieniem dzieci oraz kobiet w okresie ciąży i laktacji. Jest ona także członkiem forum ekspertów opracowujących zalecenia żywieniowe dla niemowląt i małych dzieci, kobiet w ciąży i karmiących piersią oraz ekspertem opiniującym środki spożywcze, w tym również te przeznaczone dla niemowląt i dzieci.
